雖然只有一字之別，實際區別卻非常明顯，主要區別有以下幾個方面。

最大區別是股權性質不同。農村商業銀行屬于地方性銀行業金融機構，其控股股東一般是地方國資或企業控股，其他產業資本和民間資本可以參股，而農業銀行屬于6大國有商業銀行之一，由中央國資（匯金公司）控股，并引進其他戰略投資者。

其次，企業市場定位不同。雖然農村商業銀行和農業銀行同屬于銀行業金融機構，但二者定位區別很大。前者定位于服務地方經濟發展，為當地“三農”農業、農村、農民等中小企業和個人提供金融服務，通俗的說存貸款等業務不得跨區發展。而農業銀行則因為屬于全國性大型商業銀行，它可以為全國范圍內各種企業和個人提供多種產品和服務，并開展金融市場業務和資產管理業務，包括海外金融業務。

第三，規模和品牌影響力不同。農村商業銀行以市級為獨立法人組織，各自為陣，自成一體，目前我國共有農村商業銀行1400多家，總資產30萬億左右。而農業銀行則是一家實行全國一級法人制的大型上市銀行，擁有覆蓋全國物理網點2萬多個，員工超過40萬，截止2020年6月底總資產高達26.47萬億，在全國范圍內僅次于工商銀行和建設銀行，排名第三，是不折不扣的“國家隊”主力，也因此成為全球系統重要性銀行，全球1000家大型銀行之一，各種榮耀加持，享譽全球。

第四，成立時間不同。農商銀行的前身是實際是農村信用社，2003年國家發布改制試點方案后，2004年第一家農村商業銀行江蘇吳江農商銀行才誕生，所以整體而言，農村商業銀行還是一批年輕的銀行。而農業銀行最早建立于1951年，期間與人民銀行多次合并分離，最終于1979年恢復成立至今，算是我國一家老牌銀行。

總之，如果形象比喻，農村商業銀行與農業銀行比較，就如航母與小船，大哥與小弟，國家隊與地方組織，世界名牌與一般品牌一樣，雖然同屬銀行業金融機構，但區別太大。